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課程名稱 |
蛋白體數據分析
Proteomics Data Analysis |
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開課學期 |
105-1 |
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授課對象 |
生命科學院 生命科學系 |
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授課教師 |
阮雪芬 |
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課號 |
BEBI5008 |
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課程識別碼 |
945 U2980 |
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班次 |
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學分 |
1 |
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全/半年 |
半年 |
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必/選修 |
選修 |
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上課時間 |
星期二6,7(13:20~15:10) |
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上課地點 |
生科4A |
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備註 |
與戴桓青教授合開。
先修過生物化學、分子細胞學或生物資訊學。需自備電腦。與戴桓青合開
總人數上限：50人 |
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Ceiba 課程網頁 |
http://ceiba.ntu.edu.tw/1051BEBI5008_PDA |
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課程簡介影片 |
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核心能力關聯 |
核心能力與課程規劃關聯圖 |
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課程大綱
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為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
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課程概述 |
二十一世紀是數據科學的時代，生物的數據也因為各種技術的發展，而有了大量的數據產生。舉凡定序資料、基因體資料和蛋白體資料都需要藉由資訊方法和工具而獲取有用的資訊。定量蛋白體學主要是依據質譜方法而建立，如何分析質譜產生的數據是當前非常重要的一個環節。這門課主要讓學生親自操作電腦軟體。 |
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課程目標 |
本課程主要讓學生學會如何分析蛋白體質譜數據、解讀數據、生物網路功能分析，並能尋找藥物標的和可能的藥物。
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課程要求 |
先修過生物化學、分子細胞學或生物資訊學。需自備電腦。
Homework: 70%
Final reports: 30%
此為密集課程：
1. (9/13) 蛋白體學介紹
(9/20 停課一週)
2. (9/27) 質譜儀器分析 (戴桓青)
3. (10/4) 質譜數據分析 I
4. (10/11) 質譜數據分析II
5. (10/18) 後修飾之質譜數據分析I
6. (10/25) 後修飾之質譜數據分析II
7. (11/1) 蛋白體數據上傳及網路功能分析
8. (11/8) 尋找藥物標靶及藥物 (對接模擬)
9. (11/15) 期末報告
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預期每週課後學習時數 |
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Office Hours |
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指定閱讀 |
待補 |
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參考書目 |
蛋白體相關期刊論文及自行編製的講義 |
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評量方式
(僅供參考) |
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週次 |
日期 |
單元主題 |
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第1週 |
9/13 |
蛋白體學介紹 |
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第2週 |
9/20 |
HUPO 停課一周 |
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第3週 |
9/27 |
質譜儀器分析 (戴桓青) |
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第4週 |
10/04 |
質譜數據分析 I |
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第5週 |
10/11 |
質譜數據分析II |
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第7週 |
10/25 |
後修飾之質譜數據分析II |
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第8週 |
11/01 |
蛋白體數據上傳及網路功能分析 |
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第9週 |
11/08 |
尋找藥物標靶及藥物 (對接模擬) |
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第10週 |
11/15 |
校慶放假 |
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第11週 |
11/22 |
期末口頭報告 |